Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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