Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3415J3QMS8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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