Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms