Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms