Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms