Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim55G3X8Y1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim55G3X8Y1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim55G3X8Y1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim55G3X8Y1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim55G3X8Y1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim55G3X8Y1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms