Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vmn1r167G3UW71 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vmn1r167G3UW71 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vmn1r167G3UW71 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vmn1r167G3UW71 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vmn1r167G3UW71 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r167G3UW71 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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