Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd5G3UW60 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms