Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20517G3UVU6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms