Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms