Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6619F6URP1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms