Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28305F6U473 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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