Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7945F6QI24 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7945F6QI24 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms