Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms