Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss56F2YMG0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss56F2YMG0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms