Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd7E9Q9W7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd7E9Q9W7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms