Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TrdnE9Q9K5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms