Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcnt4E9Q649 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms