Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17728E9Q5K2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms