Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nolc1E9Q5C9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nolc1E9Q5C9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms