Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms