Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms