Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r56E9Q4U5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn2r56E9Q4U5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms