Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3020E9Q3J7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms