Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Susd1E9Q3H4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Susd1E9Q3H4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Susd1E9Q3H4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Susd1E9Q3H4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Susd1E9Q3H4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms