Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms