Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms