Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms