Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3250E9Q1M3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms