Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930426L09RikE9Q0N7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms