Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms