Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms