Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc8E9PWG2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms