Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp839E9PUU5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms