Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms