Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms