Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calhm1D3Z291 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calhm1D3Z291 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms