Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3543D3Z235 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3543D3Z235 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3543D3Z235 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3543D3Z235 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3543D3Z235 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3543D3Z235 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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