Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms