Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms