Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms