Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip3B9EHT4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms