Protein–RNA interactions for Protein: B8JJZ9

Zfp563, Zinc finger protein 563, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp563B8JJZ9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp563B8JJZ9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp563B8JJZ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms