Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cped1B2RX70 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms