Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Abcc8B2RUS7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms