Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm4787B2RUD9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm4787B2RUD9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm4787B2RUD9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm4787B2RUD9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm4787B2RUD9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4787B2RUD9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4787B2RUD9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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