Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol7aB2RT54 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms