Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdc2B2RR83 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms