Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC035947B2RQY6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC035947B2RQY6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms