Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Pde4bB1AWC9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Pde4bB1AWC9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde4bB1AWC9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Pde4bB1AWC9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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Pde4bB1AWC9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Pde4bB1AWC9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Pde4bB1AWC9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Pde4bB1AWC9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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Pde4bB1AWC9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde4bB1AWC9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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